Lenovo y CSIR-IGIB se asocian para acelerar investigación del cáncer a través del análisis genético

La asociación con el principal instituto de investigación de secuenciación del genoma de la India aprovecha la arquitectura de la herramienta de escalabilidad y optimización genómica de alto rendimiento (GOAST) de Lenovo.

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Lenovo está colaborando con el Instituto CSIR de Genómica y Biología Integrativa (CSIR-IGIB), el instituto de investigación de secuenciación del genoma más prestigioso de la India, en una asociación única para promover el cáncer investigando profundizando en las raíces genéticas de la enfermedad.

Una parte vital del trabajo del instituto gira en torno a la investigación de la genética humana, que desempeña un papel fundamental en la identificación de trastornos genéticos, la caracterización de las mutaciones que impulsan la progresión del cáncer y el seguimiento de los brotes de enfermedades. Esta asociación utiliza la arquitectura de la herramienta de escalabilidad y optimización genómica de alto rendimiento (GOAST) de Lenovo, que cuenta con procesadores escalables Intel® Xeon® de segunda generación, para impulsar cargas de trabajo de secuenciación genómica ultraintensivas y ayudar a los investigadores a encontrar información más rápidamente. GOAST de Lenovo es una arquitectura informática de alto rendimiento (HPC) diseñada específicamente para cargas de trabajo de genómica exigentes que contribuye significativamente a esta iniciativa.

El Dr. Anurag Agrawal, exdirector de CSIR-IGIB , dijo: “La velocidad y la escala informática son fundamentales para la secuenciación genética. Nuestro objetivo es ayudar a los investigadores a analizar más muestras más rápido, y necesitábamos tecnología de alto rendimiento para lograrlo. El mayor rendimiento y capacidad informáticos que ofrece Lenovo GOAST está ayudando a acelerar el ritmo de la investigación y aumentar nuestra producción, lo que nos ayuda a impulsar el progreso científico que tiene un impacto real en la salud y la vida de las personas. Lenovo realmente ha optimizado tanto el hardware como el software para el análisis genómico y paga dividendos en términos de rendimiento y eficiencia”.

En estrecha colaboración con los servicios informáticos de alto rendimiento de Lenovo, CSIR-IGIB implementó un sistema de 28 nodos, la mayor instalación de GOAST en India hasta la fecha. Al aprovechar una arquitectura optimizada y un software eficiente de código abierto, GOAST ofrece un rendimiento a nivel de GPU a costos de nivel de CPU, lo que lo convierte en una propuesta atractiva para un organismo del sector público como CSIR-IGIB.

CSIR-IGIB ha visto un impacto significativo en el rendimiento del sistema GOAST de Lenovo para los flujos de trabajo de secuenciación del genoma completo (WGS) y secuenciación del exoma completo (WES). En ejecuciones de latencia, donde todos los recursos de un nodo se asignan para ejecutar un solo trabajo, el instituto puede completar un flujo de trabajo WGS y WES típico 6,5 veces más rápido.

Las velocidades de ejecución aceleradas permiten a los investigadores procesar más muestras y responder preguntas más complejas en menos tiempo, de 60,5 horas a 9 horas. Al mantener un ritmo de investigación más rápido, el CSIR-IGIB puede impulsar aún más el trabajo científico vital, impulsando los avances necesarios para mejorar su comprensión de enfermedades como el cáncer y encontrar mejores tratamientos que mejoren los resultados de los pacientes e incluso salven vidas.

“Es a través de instituciones como el IGIB que se están logrando avances decisivos en el cuidado de la salud, desde tratamientos y vacunas para enfermedades agudas, hasta estrategias para el manejo y superación de condiciones crónicas. Estamos encantados de asociarnos y brindar apoyo técnico crucial al nuevo Centro de Excelencia de IGIB. Es probable que se convierta en el sitio más grande para GOAST en Asia Pacífico”, dijo Sinisa Nikolic, Directora, HPC-AI, Grupo de Soluciones de Infraestructura, Lenovo Asia Pacífico.

Esta arquitectura de Lenovo respaldará una serie de iniciativas de investigación, incluidas aquellas centradas en explorar las posibles raíces genéticas del cáncer. Por ejemplo, los investigadores pueden comparar los genomas del cáncer con un genoma de referencia estándar para identificar posibles mutaciones de la línea germinal (transmitidas directamente de padres a hijos) que pueden desencadenar o promover el desarrollo del cáncer en humanos. Esto también permitiría mejorar nuestra comprensión de los cambios genéticos que pueden contribuir al cáncer; dicho análisis también puede ofrecer información valiosa sobre cómo podría progresar el cáncer de un individuo y su probable respuesta al tratamiento.

Como líder mundial en computación de alto rendimiento, Lenovo trabaja en estrecha colaboración con socios clave de la industria para desarrollar, integrar e implementar las tecnologías de computación a nivel de exaescala en organizaciones de todos los tamaños.

Fuente: NP Lenovo

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